南京中醫(yī)藥大學(xué)始建于1954年，是中國建校最早的高等中醫(yī)藥院校之一，是教育部和江蘇省共建的國家“世界一流學(xué)科建設(shè)高校”，是江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建高校、江蘇省重點建設(shè)高校、江蘇省高水平大學(xué)建設(shè)高校。
南京中醫(yī)藥大學(xué)是世界一流中醫(yī)藥大學(xué)建設(shè)聯(lián)盟、長三角醫(yī)學(xué)教育聯(lián)盟創(chuàng)始成員，是世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓(xùn)中心、全國首批博士和碩士學(xué)位授權(quán)單位、全國古籍重點保護(hù)單位、全國中醫(yī)師資進(jìn)修教育基地、國家建設(shè)高水平大學(xué)公派研究生項目實施高校、國家“特色重點學(xué)科項目”建設(shè)高校、國家“卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃”改革首批試點高校、國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、中國政府獎學(xué)金來華留學(xué)生接收院校。